Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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