Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC27P30260 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC27P30260 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC27P30260 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC27P30260 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC27P30260 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC27P30260 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms