Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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FAM58BPP0C7Q3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FAM58BPP0C7Q3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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