Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LTAP01374 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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