Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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