Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms