Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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