Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE16-202ENST00000632547 3434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 N4BP2L1-202ENST00000380130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PAX6-257ENST00000639409 2450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FCRLA-214ENST00000546024 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB4P11-202ENST00000600530 2079 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC18A1-202ENST00000276373 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf127-201ENST00000377004 2761 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02170-202ENST00000562231 2218 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL021392.1-201ENST00000426112 2949 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX1T1-202ENST00000360348 2370 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UGT1A4-201ENST00000373409 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF221-201ENST00000251269 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TROAP-201ENST00000257909 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UNC93A-202ENST00000366829 1810 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AWAT2-201ENST00000276101 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ATAT1-203ENST00000329992 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms