Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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