Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms