Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCKAP1LP55160 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCKAP1LP55160 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms