Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms