Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MLH1P40692 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MLH1P40692 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MLH1P40692 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MLH1P40692 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
MLH1P40692 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MLH1P40692 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MLH1P40692 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms