Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8W031 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F8W031 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
F8W031 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
F8W031 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms