Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC02170-202ENST00000562231 2218 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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SPOCK3Q9BQ16 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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SPOCK3Q9BQ16 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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SPOCK3Q9BQ16 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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SPOCK3Q9BQ16 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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SPOCK3Q9BQ16 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SP100-206ENST00000409897 2037 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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