Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIN3AQ96ST3 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms