Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM47Q96LD4 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms