Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SIRPB1-204ENST00000381603 1715 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC104394.1-201ENST00000611658 1748 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC245884.11-201ENST00000616950 1734 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO25-201ENST00000276326 2104 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC068775.1-201ENST00000322446 2142 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FCGR2B-202ENST00000358671 2115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ACVR2B-AS1-201ENST00000441531 2517 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01940-201ENST00000455228 3489 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP36L1-204ENST00000555997 3094 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SHANK2-AS1-201ENST00000429561 2252 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02172-201ENST00000507365 2264 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN2-204ENST00000358472 3231 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL3-201ENST00000342868 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC139099.1-202ENST00000574098 2409 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA33-201ENST00000301031 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ESM1-202ENST00000381405 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZPLD1-204ENST00000491959 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms