RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276326.9

FBXO25-201, Transcript of F-box protein 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO25, Length 2,104 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO25-201ENST00000276326 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.32■■□□□ 1.48
FBXO25-201ENST00000276326 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.1■□□□□ 0.97
FBXO25-201ENST00000276326 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
FBXO25-201ENST00000276326 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.49■□□□□ 0.87
FBXO25-201ENST00000276326 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
FBXO25-201ENST00000276326 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.19■□□□□ 0.82
FBXO25-201ENST00000276326 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.98■□□□□ 0.79
FBXO25-201ENST00000276326 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.84■□□□□ 0.77
FBXO25-201ENST00000276326 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.82■□□□□ 0.76
FBXO25-201ENST00000276326 HRCP23327 699 aa19.81■□□□□ 0.76
FBXO25-201ENST00000276326 NACADO15069 1562 aa19.55■□□□□ 0.72
FBXO25-201ENST00000276326 ABCC9O60706 1549 aa19.52■□□□□ 0.72
FBXO25-201ENST00000276326 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.46■□□□□ 0.71
FBXO25-201ENST00000276326 SCRIBQ14160 1630 aa19.34■□□□□ 0.69
FBXO25-201ENST00000276326 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.28■□□□□ 0.68
FBXO25-201ENST00000276326 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.67
FBXO25-201ENST00000276326 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
FBXO25-201ENST00000276326 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.21■□□□□ 0.67
FBXO25-201ENST00000276326 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
FBXO25-201ENST00000276326 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
FBXO25-201ENST00000276326 TRIM41Q8WV44 630 aa19.03■□□□□ 0.64
FBXO25-201ENST00000276326 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.89■□□□□ 0.61
FBXO25-201ENST00000276326 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.81■□□□□ 0.6
FBXO25-201ENST00000276326 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.8■□□□□ 0.6
FBXO25-201ENST00000276326 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
FBXO25-201ENST00000276326 WIZO95785 1651 aa18.68■□□□□ 0.58
FBXO25-201ENST00000276326 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
FBXO25-201ENST00000276326 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.67■□□□□ 0.58
FBXO25-201ENST00000276326 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
FBXO25-201ENST00000276326 SMARCA4P51532 1647 aa18.62■□□□□ 0.57
FBXO25-201ENST00000276326 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
FBXO25-201ENST00000276326 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FBXO25-201ENST00000276326 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.55
FBXO25-201ENST00000276326 EEA1Q15075 1411 aa18.47■□□□□ 0.55
FBXO25-201ENST00000276326 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.43■□□□□ 0.54
FBXO25-201ENST00000276326 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
FBXO25-201ENST00000276326 SMARCA2P51531 1590 aa18.4■□□□□ 0.54
FBXO25-201ENST00000276326 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.38■□□□□ 0.53
FBXO25-201ENST00000276326 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.37■□□□□ 0.53
FBXO25-201ENST00000276326 CEP162Q5TB80 1403 aa18.31■□□□□ 0.52
FBXO25-201ENST00000276326 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
FBXO25-201ENST00000276326 ABCC8Q09428 1581 aa18.29■□□□□ 0.52
FBXO25-201ENST00000276326 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.27■□□□□ 0.52
FBXO25-201ENST00000276326 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
FBXO25-201ENST00000276326 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
FBXO25-201ENST00000276326 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.21■□□□□ 0.51
FBXO25-201ENST00000276326 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.21■□□□□ 0.51
FBXO25-201ENST00000276326 GOLGA3Q08378 1498 aa18.2■□□□□ 0.5
FBXO25-201ENST00000276326 SOGA1O94964 1423 aa18.18■□□□□ 0.5
FBXO25-201ENST00000276326 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
FBXO25-201ENST00000276326 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
FBXO25-201ENST00000276326 KIF21BO75037 1637 aa18.12■□□□□ 0.49
FBXO25-201ENST00000276326 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
FBXO25-201ENST00000276326 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.11■□□□□ 0.49
FBXO25-201ENST00000276326 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FBXO25-201ENST00000276326 HMGXB3Q12766 1538 aa18.05■□□□□ 0.48
FBXO25-201ENST00000276326 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
FBXO25-201ENST00000276326 NCAPD3P42695 1498 aa18.03■□□□□ 0.48
FBXO25-201ENST00000276326 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.02■□□□□ 0.48
FBXO25-201ENST00000276326 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
FBXO25-201ENST00000276326 NEUROD1Q13562 356 aa17.96■□□□□ 0.47
FBXO25-201ENST00000276326 SYNJ1O43426 1573 aa17.95■□□□□ 0.46
FBXO25-201ENST00000276326 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.95■□□□□ 0.46
FBXO25-201ENST00000276326 CLIP1P30622 1438 aa17.94■□□□□ 0.46
FBXO25-201ENST00000276326 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.85■□□□□ 0.45
FBXO25-201ENST00000276326 TOP2BQ02880 1626 aa17.84■□□□□ 0.45
FBXO25-201ENST00000276326 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.83■□□□□ 0.44
FBXO25-201ENST00000276326 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.82■□□□□ 0.44
FBXO25-201ENST00000276326 APLP2Q06481 763 aa17.82■□□□□ 0.44
FBXO25-201ENST00000276326 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
FBXO25-201ENST00000276326 MYT1Q01538 1121 aa17.8■□□□□ 0.44
FBXO25-201ENST00000276326 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.8■□□□□ 0.44
FBXO25-201ENST00000276326 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.78■□□□□ 0.44
FBXO25-201ENST00000276326 PRXQ9BXM0 1461 aa17.72■□□□□ 0.43
FBXO25-201ENST00000276326 CFTRP13569 1480 aa17.71■□□□□ 0.43
FBXO25-201ENST00000276326 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.7■□□□□ 0.42
FBXO25-201ENST00000276326 PRDM2Q13029 1718 aa17.69■□□□□ 0.42
FBXO25-201ENST00000276326 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
FBXO25-201ENST00000276326 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
FBXO25-201ENST00000276326 CUX2O14529 1486 aa17.6■□□□□ 0.41
FBXO25-201ENST00000276326 ARAP1Q96P48 1450 aa17.6■□□□□ 0.41
FBXO25-201ENST00000276326 MIER1Q8N108 512 aa17.59■□□□□ 0.41
FBXO25-201ENST00000276326 KIF27Q86VH2 1401 aa17.58■□□□□ 0.41
FBXO25-201ENST00000276326 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
FBXO25-201ENST00000276326 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.56■□□□□ 0.4
FBXO25-201ENST00000276326 CUX1P39880 1505 aa17.53■□□□□ 0.4
FBXO25-201ENST00000276326 MAP3K1Q13233 1512 aa17.51■□□□□ 0.39
FBXO25-201ENST00000276326 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
FBXO25-201ENST00000276326 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.45■□□□□ 0.38
FBXO25-201ENST00000276326 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.43■□□□□ 0.38
FBXO25-201ENST00000276326 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
FBXO25-201ENST00000276326 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.37■□□□□ 0.37
FBXO25-201ENST00000276326 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.36■□□□□ 0.37
FBXO25-201ENST00000276326 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
FBXO25-201ENST00000276326 TIAM1Q13009 1591 aa17.34■□□□□ 0.37
FBXO25-201ENST00000276326 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.3■□□□□ 0.36
FBXO25-201ENST00000276326 IGF1RP08069 1367 aa17.3■□□□□ 0.36
FBXO25-201ENST00000276326 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.3■□□□□ 0.36
FBXO25-201ENST00000276326 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.29■□□□□ 0.36
FBXO25-201ENST00000276326 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms