Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL021392.1-201ENST00000426112 2949 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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