Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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