Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MMP13P45452 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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MMP13P45452 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MMP13P45452 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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