Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFNP31947 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFNP31947 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFNP31947 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms