Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMIM10L2BP0DMW5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms