Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms