Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms