Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms