Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FANCFQ9NPI8 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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FANCFQ9NPI8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FANCFQ9NPI8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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