Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
ACTR3CQ9C0K3 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ACTR3CQ9C0K3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 408.5 ms