Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms