Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms