Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AR-201ENST00000374690 10652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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