Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TAF11Q15544 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms