Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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TLR1Q15399 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TLR1Q15399 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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