Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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