Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BTNL3-201ENST00000342868 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 LINC01166-201ENST00000443633 2619 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 RANBP20P-201ENST00000557256 2104 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 RIC3-203ENST00000343202 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CDH5-208ENST00000614547 3779 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 NRIP2-201ENST00000337508 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 LBHD1-204ENST00000431002 2915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD300CQ08708 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms