Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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