Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGAEP38570 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms