Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MARCKSP29966 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MARCKSP29966 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms