Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CREB3O43889 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CREB3O43889 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREB3O43889 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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