Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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