Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms