Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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