Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms