Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01634-201ENST00000443243 2379 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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