Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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