Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNA1P78396 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms