Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms