Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP13P45452 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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