Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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